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研究者重建5萬多年前猛犸象染色體3D結(jié)構(gòu)

新華社北京7月17日電 一個(gè)國際研究團(tuán)隊(duì)日前報(bào)告說,他們重建了5.2萬年前的猛犸象染色體3D結(jié)構(gòu)。該研究結(jié)果讓科研人員能夠在基因組層面更深入了解猛犸象。

一個(gè)由美國貝勒醫(yī)學(xué)院等機(jī)構(gòu)研究人員組成的國際團(tuán)隊(duì)在《細(xì)胞》雜志上發(fā)表論文說,他們在5年里測試了數(shù)十個(gè)樣本,最終選中了于2018年在西伯利亞東北部挖掘出的一具保存異常良好的猛犸象樣本。

這只猛犸象死后不久被凍干了,而脫水樣本中的細(xì)胞核結(jié)構(gòu)可以保存很長時(shí)間,研究人員由此可探究樣本的染色體組核型,即染色體的數(shù)目、大小和形態(tài)特征等。

研究人員使用了一種名為Hi-C的方法從猛犸象耳后皮膚樣本中提取了DNA,將其相關(guān)物理信息與DNA測序相結(jié)合,以識別相互作用的DNA片段,并使用當(dāng)今大象的基因組作為模板,成功創(chuàng)建了該猛犸象基因組的有序圖譜,并建立相關(guān)的染色體3D結(jié)構(gòu)。

進(jìn)一步的分析顯示,被研究的這頭猛犸象有28條染色體,這與當(dāng)今亞洲象和非洲象的染色體數(shù)量相同,該猛犸象的染色體還保留了大量物理完整性和細(xì)節(jié)。此外,與其近親亞洲象的皮膚細(xì)胞相比,猛犸象皮膚細(xì)胞具有不同的基因激活模式,包括可能與其毛發(fā)和耐寒性相關(guān)的基因等。

盡管這項(xiàng)研究中使用的方法取決于保存完好的古老樣本,但研究人員樂觀地認(rèn)為,該方法也可用于研究其他古代DNA標(biāo)本等。

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